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miRNA表達譜檢測
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miRNA表達譜檢測
服務概述
miRNA(microRNA)是一類長度約為20-24nt 的內源性非編碼RNA,廣泛參與基因轉錄后調控活動,其中多數miRNA具有高度序列保守性、表達時序性和組織特異性。近的研究表明,miRNA參與了各種各樣的調節途徑,包括細胞增殖與凋亡、生長發育、器官形成、造血過程、脂肪代謝、病毒防御等各種功能,具有重要的基因表達調控作用。
現在主流的芯片平臺是Agilent和Affymetrix,Agilent只檢出成熟體,而Affymetrix的芯片前體和成熟體皆檢出,假陽性率較高,但Affymetrix的容量相比Agilent的大很多。我們可提供Agilent和Affymetrix平臺的microarray篩選服務及后續的芯片數據分析及靶基因聚類分析。
miRNA表達譜芯片數據標準分析:
  • 表達差異分析:對于使用參照實驗設計進行的重復實驗, 可以對多個樣本的基因表達數據進行差異基因表達分析, 具體方法包括差異倍數分析、t檢驗等。
  • 聚類分析:聚類分析是通過建立各種不同的數學模型,把基于相似數據特征的變量或樣本組合在一起。歸為一個簇的基因在功能上可能相似或關聯,從而找到未知基因的功能信息或已知基因的未知功能。
miRNA表達譜芯片數據分析:
  • miRNA靶基因預測及信號通路分析:靶基因預測是miRNA功能研究上的有力工具。通過對多個數據庫的靶基因預測結果統計,可以進一步縮小靶基因范圍,為實驗驗證提供指導。結合基因表達譜芯片檢測結果,可以更有效地分析miRNA靶基因。
  • miRNA靶基因調控網絡構建:miRNA在細胞內具有多種重要的調節作用。一個miRNA可能有多個靶基因,而一個基因很可能受多個miRNA的調控。miRNA調控多個基因的表達,也可以通過幾個miRNA的組合來精細調控某個基因的表達。針對客戶感興趣的若干個特定miRNA,運用生物信息學的方法和技術通過文獻挖掘研究復雜的miRNA調控網絡關系,揭示有關的作用機理。
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